Sergio, complimenti vivissimi per il primo spettro stellare con l'Alpy 600! A me sembra ottimo, la differenza di pendenza del continuo con quello dello spettro ARAS preso a riferimento e' lievissima e fra l'altro non sappiamo se sia rigorosamente corretto.
ISIS non salva automaticamente la videata della funzione "Compare", potresti usare la funzione Gnuplot -> Double plot fornendo il nome dei due profili riscalati nello stesso intervallo e i parametri (range e scala) ma credo che fai prima con Plotspectra.
Dopo aver aperto i due profili cosi' come sono, con il mouse selezioni la regione in cui riscalarli (di solito si impiega un intervallo subito a destra della riga H-alfa ma per lo scopo va bene anche altrove) e, con il tasto destro del mouse scegli "Normalize" -> "To active series" nel menu contestuale:
Il risultato dove i profili coincidono nella zona adottata per il riscalamento dell'intensita' al valore unitario:
Paolo